Pigmentet melanin er den viktigste faktoren som avgjør øyenfargen vår. Jo mer melanin, jo mørkere blir fargen.
Små mengder melanin i øyets regnbuehinne, også kalt iris, får øynene til å se blå ut.
Fargen finnes ikke inne i øynene. Vi oppfatter blått på grunn av den måten lyset blir spredt og reflektert ut i luften på.
Fenomenet er beslektet med den måten sollys blir spredt av molekyler i atmosfæren, slik at himmelen får sin blå farge.