Grunnen til at innavl er skadelig, er at den reduserer den genetiske variasjonen i dyregruppen, slik at skadelige genvarianter kan hope seg opp og få fatale følger.
De fleste genene finnes i to varianter, og den ene kan godt være skadelig. Hvis den andre genvarianten er funksjonsdyktig, overtrumfer den normalt den skadelige, og dyret blir såkalt heterozygot for dette genet.
Skadelige gener ender i samme unge
Men når to heterozygote dyr parer seg, blir genene blandet slik at de skadelige genvariantene i 25 prosent av tilfellene ender i det samme fosteranlegget og vil gjøre ungen såkalt homozygot for genet – og mindre levedyktig. I
I en liten populasjon, der det ikke er mulig å unngå innavl, stiger risikoen for at to heterozygote dyr parer seg.
Biologene er veldig bevisste på konsekvensene av innavl i for eksempel zoologiske hager og innen hundeavl, der nye raser blir skapt ut fra noen ganske få individer. Likevel sliter noen hunderaser med innavl.
Dalmatinere er for eksempel utsatt for å få nyrestein på grunn av en skadelig genvariant som, hvis den opptrer i dobbel utgave, gjør at hunden skiller ut ekstra store mengder urinsyre.